Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms