Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms