Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms