Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSSK4Q6SA08 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms