Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms