Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms