Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC29■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC29■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EFCAB2Q5VUJ9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms