Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOGA3Q5TF21 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOGA3Q5TF21 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOGA3Q5TF21 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOGA3Q5TF21 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SOGA3Q5TF21 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SOGA3Q5TF21 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOGA3Q5TF21 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOGA3Q5TF21 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOGA3Q5TF21 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SOGA3Q5TF21 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOGA3Q5TF21 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOGA3Q5TF21 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOGA3Q5TF21 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOGA3Q5TF21 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOGA3Q5TF21 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOGA3Q5TF21 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOGA3Q5TF21 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOGA3Q5TF21 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOGA3Q5TF21 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOGA3Q5TF21 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOGA3Q5TF21 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOGA3Q5TF21 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOGA3Q5TF21 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOGA3Q5TF21 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOGA3Q5TF21 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOGA3Q5TF21 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOGA3Q5TF21 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOGA3Q5TF21 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOGA3Q5TF21 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOGA3Q5TF21 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOGA3Q5TF21 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms