Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEND3Q5T5X7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms