Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms