Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC158Q5M9N0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC158Q5M9N0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms