Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms