Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms