Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.2 ms