Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PRR4Q16378 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PRR4Q16378 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms