Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDCD2Q16342 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms