Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETFDHQ16134 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms