Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
VPS72Q15906 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
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