Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
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