Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ARHGEF6Q15052 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGEF6Q15052 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGEF6Q15052 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGEF6Q15052 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGEF6Q15052 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGEF6Q15052 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGEF6Q15052 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGEF6Q15052 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGEF6Q15052 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGEF6Q15052 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGEF6Q15052 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGEF6Q15052 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGEF6Q15052 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGEF6Q15052 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGEF6Q15052 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGEF6Q15052 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGEF6Q15052 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGEF6Q15052 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGEF6Q15052 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGEF6Q15052 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGEF6Q15052 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGEF6Q15052 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGEF6Q15052 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGEF6Q15052 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGEF6Q15052 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGEF6Q15052 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGEF6Q15052 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGEF6Q15052 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGEF6Q15052 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGEF6Q15052 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGEF6Q15052 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGEF6Q15052 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms