Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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