Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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