Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HTR4Q13639 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HTR4Q13639 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HTR4Q13639 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HTR4Q13639 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HTR4Q13639 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HTR4Q13639 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HTR4Q13639 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HTR4Q13639 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HTR4Q13639 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
HTR4Q13639 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
HTR4Q13639 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
HTR4Q13639 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
HTR4Q13639 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
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HTR4Q13639 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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HTR4Q13639 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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HTR4Q13639 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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HTR4Q13639 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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HTR4Q13639 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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HTR4Q13639 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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