Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PKD2Q13563 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
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