Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRQ13535 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRQ13535 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRQ13535 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRQ13535 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRQ13535 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRQ13535 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRQ13535 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRQ13535 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRQ13535 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRQ13535 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRQ13535 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRQ13535 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRQ13535 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRQ13535 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRQ13535 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRQ13535 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRQ13535 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRQ13535 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRQ13535 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRQ13535 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRQ13535 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRQ13535 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRQ13535 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRQ13535 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRQ13535 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRQ13535 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRQ13535 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRQ13535 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRQ13535 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRQ13535 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRQ13535 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRQ13535 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRQ13535 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRQ13535 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRQ13535 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRQ13535 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRQ13535 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRQ13535 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRQ13535 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRQ13535 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRQ13535 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRQ13535 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRQ13535 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRQ13535 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRQ13535 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRQ13535 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRQ13535 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRQ13535 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRQ13535 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRQ13535 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRQ13535 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRQ13535 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRQ13535 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRQ13535 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRQ13535 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRQ13535 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRQ13535 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRQ13535 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRQ13535 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRQ13535 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRQ13535 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRQ13535 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRQ13535 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRQ13535 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRQ13535 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRQ13535 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRQ13535 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATRQ13535 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATRQ13535 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATRQ13535 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATRQ13535 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ATRQ13535 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRQ13535 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRQ13535 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRQ13535 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRQ13535 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRQ13535 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRQ13535 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRQ13535 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRQ13535 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRQ13535 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRQ13535 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRQ13535 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRQ13535 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRQ13535 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRQ13535 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRQ13535 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRQ13535 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRQ13535 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRQ13535 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRQ13535 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRQ13535 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATRQ13535 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRQ13535 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRQ13535 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRQ13535 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRQ13535 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRQ13535 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRQ13535 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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