Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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