Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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