Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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FOXC1Q12948 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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