Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms