Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC9Q06265 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms