Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A2Q05940 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms