Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms