Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms