Protein–RNA interactions for Protein: P78509

RELN, Reelin, humanhuman

Predictions only

Length 3,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELNP78509 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RELNP78509 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RELNP78509 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RELNP78509 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RELNP78509 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RELNP78509 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RELNP78509 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RELNP78509 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RELNP78509 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RELNP78509 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RELNP78509 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RELNP78509 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RELNP78509 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELNP78509 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELNP78509 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RELNP78509 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELNP78509 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELNP78509 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELNP78509 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELNP78509 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELNP78509 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELNP78509 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELNP78509 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RELNP78509 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELNP78509 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELNP78509 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELNP78509 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELNP78509 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELNP78509 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELNP78509 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELNP78509 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELNP78509 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELNP78509 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELNP78509 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELNP78509 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELNP78509 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELNP78509 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELNP78509 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RELNP78509 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELNP78509 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELNP78509 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELNP78509 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELNP78509 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELNP78509 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELNP78509 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RELNP78509 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELNP78509 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RELNP78509 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RELNP78509 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RELNP78509 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RELNP78509 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RELNP78509 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RELNP78509 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RELNP78509 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELNP78509 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELNP78509 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RELNP78509 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELNP78509 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELNP78509 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELNP78509 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RELNP78509 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELNP78509 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELNP78509 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELNP78509 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELNP78509 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELNP78509 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RELNP78509 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RELNP78509 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELNP78509 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELNP78509 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELNP78509 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELNP78509 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELNP78509 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELNP78509 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELNP78509 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELNP78509 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELNP78509 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELNP78509 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELNP78509 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELNP78509 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELNP78509 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELNP78509 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELNP78509 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELNP78509 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELNP78509 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELNP78509 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELNP78509 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELNP78509 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELNP78509 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELNP78509 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELNP78509 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RELNP78509 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELNP78509 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELNP78509 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELNP78509 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELNP78509 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RELNP78509 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELNP78509 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELNP78509 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELNP78509 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms