Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P61574 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms