Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB25P57735 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB25P57735 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB25P57735 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB25P57735 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB25P57735 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB25P57735 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB25P57735 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB25P57735 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB25P57735 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB25P57735 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB25P57735 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB25P57735 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB25P57735 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB25P57735 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB25P57735 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB25P57735 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB25P57735 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB25P57735 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB25P57735 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB25P57735 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB25P57735 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB25P57735 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB25P57735 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB25P57735 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB25P57735 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB25P57735 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB25P57735 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB25P57735 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB25P57735 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB25P57735 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB25P57735 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB25P57735 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB25P57735 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB25P57735 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB25P57735 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB25P57735 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB25P57735 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB25P57735 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB25P57735 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB25P57735 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB25P57735 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB25P57735 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB25P57735 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB25P57735 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB25P57735 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB25P57735 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB25P57735 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB25P57735 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB25P57735 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB25P57735 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB25P57735 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB25P57735 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB25P57735 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB25P57735 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB25P57735 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB25P57735 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB25P57735 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB25P57735 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB25P57735 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms