Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms