Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA4P51532 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms