Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCAMP50895 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCAMP50895 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCAMP50895 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCAMP50895 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCAMP50895 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCAMP50895 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCAMP50895 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCAMP50895 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAMP50895 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAMP50895 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAMP50895 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAMP50895 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAMP50895 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAMP50895 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAMP50895 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAMP50895 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAMP50895 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAMP50895 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAMP50895 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAMP50895 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAMP50895 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAMP50895 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAMP50895 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAMP50895 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAMP50895 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAMP50895 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAMP50895 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAMP50895 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAMP50895 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAMP50895 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAMP50895 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAMP50895 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAMP50895 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAMP50895 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAMP50895 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAMP50895 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAMP50895 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAMP50895 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAMP50895 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAMP50895 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAMP50895 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAMP50895 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAMP50895 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAMP50895 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAMP50895 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAMP50895 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAMP50895 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAMP50895 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAMP50895 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAMP50895 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAMP50895 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAMP50895 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAMP50895 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAMP50895 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAMP50895 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAMP50895 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAMP50895 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAMP50895 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAMP50895 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAMP50895 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAMP50895 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAMP50895 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAMP50895 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAMP50895 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAMP50895 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAMP50895 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAMP50895 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAMP50895 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAMP50895 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
BCAMP50895 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
BCAMP50895 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
BCAMP50895 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAMP50895 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAMP50895 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAMP50895 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAMP50895 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAMP50895 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAMP50895 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAMP50895 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAMP50895 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAMP50895 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAMP50895 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAMP50895 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAMP50895 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAMP50895 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAMP50895 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAMP50895 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAMP50895 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAMP50895 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAMP50895 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAMP50895 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAMP50895 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAMP50895 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAMP50895 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAMP50895 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAMP50895 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAMP50895 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCAMP50895 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCAMP50895 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms