Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms