Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
NESP48681 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
NESP48681 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NESP48681 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NESP48681 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NESP48681 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NESP48681 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NESP48681 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NESP48681 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NESP48681 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NESP48681 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
NESP48681 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NESP48681 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
NESP48681 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
NESP48681 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NESP48681 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NESP48681 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NESP48681 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NESP48681 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NESP48681 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NESP48681 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NESP48681 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NESP48681 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NESP48681 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NESP48681 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NESP48681 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NESP48681 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NESP48681 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NESP48681 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NESP48681 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NESP48681 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NESP48681 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NESP48681 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NESP48681 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NESP48681 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NESP48681 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NESP48681 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NESP48681 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NESP48681 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NESP48681 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NESP48681 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
NESP48681 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NESP48681 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NESP48681 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NESP48681 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NESP48681 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NESP48681 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NESP48681 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
NESP48681 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
NESP48681 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NESP48681 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NESP48681 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NESP48681 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NESP48681 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NESP48681 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NESP48681 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NESP48681 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NESP48681 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NESP48681 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NESP48681 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NESP48681 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NESP48681 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NESP48681 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NESP48681 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NESP48681 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NESP48681 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NESP48681 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
NESP48681 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NESP48681 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NESP48681 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NESP48681 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NESP48681 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NESP48681 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
NESP48681 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NESP48681 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NESP48681 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NESP48681 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NESP48681 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NESP48681 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NESP48681 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NESP48681 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NESP48681 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NESP48681 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NESP48681 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
NESP48681 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NESP48681 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NESP48681 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NESP48681 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NESP48681 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NESP48681 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NESP48681 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
NESP48681 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
NESP48681 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
NESP48681 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NESP48681 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NESP48681 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
NESP48681 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NESP48681 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NESP48681 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NESP48681 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms