Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA8P48165 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA8P48165 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA8P48165 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA8P48165 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA8P48165 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA8P48165 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA8P48165 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GJA8P48165 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA8P48165 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA8P48165 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA8P48165 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA8P48165 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA8P48165 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA8P48165 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA8P48165 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA8P48165 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA8P48165 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA8P48165 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA8P48165 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA8P48165 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA8P48165 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA8P48165 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA8P48165 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GJA8P48165 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA8P48165 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GJA8P48165 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GJA8P48165 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA8P48165 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA8P48165 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA8P48165 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA8P48165 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA8P48165 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA8P48165 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA8P48165 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA8P48165 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA8P48165 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA8P48165 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA8P48165 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA8P48165 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA8P48165 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA8P48165 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA8P48165 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GJA8P48165 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GJA8P48165 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA8P48165 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA8P48165 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA8P48165 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA8P48165 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJA8P48165 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJA8P48165 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA8P48165 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJA8P48165 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJA8P48165 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJA8P48165 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA8P48165 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJA8P48165 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA8P48165 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA8P48165 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA8P48165 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA8P48165 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA8P48165 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GJA8P48165 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GJA8P48165 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GJA8P48165 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJA8P48165 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJA8P48165 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA8P48165 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA8P48165 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJA8P48165 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJA8P48165 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA8P48165 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA8P48165 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA8P48165 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA8P48165 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA8P48165 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA8P48165 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA8P48165 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA8P48165 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA8P48165 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA8P48165 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA8P48165 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA8P48165 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA8P48165 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA8P48165 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA8P48165 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA8P48165 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA8P48165 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA8P48165 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA8P48165 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA8P48165 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA8P48165 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA8P48165 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA8P48165 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA8P48165 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA8P48165 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA8P48165 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA8P48165 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA8P48165 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA8P48165 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms