Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHKA1P46020 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms