Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPOP42166 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPOP42166 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPOP42166 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPOP42166 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPOP42166 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPOP42166 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPOP42166 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPOP42166 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPOP42166 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPOP42166 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPOP42166 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPOP42166 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPOP42166 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPOP42166 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPOP42166 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPOP42166 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPOP42166 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPOP42166 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPOP42166 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPOP42166 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPOP42166 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPOP42166 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPOP42166 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPOP42166 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPOP42166 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPOP42166 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPOP42166 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPOP42166 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPOP42166 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPOP42166 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPOP42166 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPOP42166 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPOP42166 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPOP42166 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPOP42166 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPOP42166 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPOP42166 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPOP42166 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMPOP42166 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMPOP42166 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMPOP42166 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMPOP42166 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMPOP42166 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMPOP42166 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMPOP42166 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMPOP42166 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMPOP42166 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TMPOP42166 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMPOP42166 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMPOP42166 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMPOP42166 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMPOP42166 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMPOP42166 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPOP42166 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPOP42166 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPOP42166 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPOP42166 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPOP42166 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPOP42166 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPOP42166 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPOP42166 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPOP42166 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPOP42166 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPOP42166 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPOP42166 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPOP42166 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPOP42166 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPOP42166 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPOP42166 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPOP42166 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPOP42166 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPOP42166 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPOP42166 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPOP42166 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPOP42166 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPOP42166 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPOP42166 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPOP42166 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPOP42166 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPOP42166 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPOP42166 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPOP42166 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMPOP42166 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMPOP42166 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMPOP42166 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMPOP42166 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMPOP42166 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMPOP42166 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMPOP42166 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMPOP42166 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMPOP42166 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMPOP42166 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMPOP42166 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMPOP42166 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMPOP42166 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMPOP42166 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMPOP42166 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMPOP42166 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TMPOP42166 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms