Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms