Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms