Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP6P35125 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP6P35125 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
USP6P35125 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP6P35125 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP6P35125 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP6P35125 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP6P35125 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP6P35125 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP6P35125 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP6P35125 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP6P35125 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
USP6P35125 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP6P35125 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP6P35125 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP6P35125 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP6P35125 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP6P35125 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP6P35125 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP6P35125 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP6P35125 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP6P35125 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP6P35125 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP6P35125 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
USP6P35125 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP6P35125 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP6P35125 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP6P35125 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP6P35125 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP6P35125 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP6P35125 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP6P35125 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP6P35125 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP6P35125 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP6P35125 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP6P35125 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP6P35125 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USP6P35125 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP6P35125 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP6P35125 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP6P35125 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP6P35125 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP6P35125 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP6P35125 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
USP6P35125 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP6P35125 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP6P35125 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP6P35125 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP6P35125 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP6P35125 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP6P35125 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP6P35125 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP6P35125 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP6P35125 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP6P35125 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP6P35125 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP6P35125 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP6P35125 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP6P35125 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP6P35125 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP6P35125 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP6P35125 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP6P35125 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP6P35125 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP6P35125 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP6P35125 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP6P35125 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP6P35125 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP6P35125 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP6P35125 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP6P35125 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP6P35125 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP6P35125 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP6P35125 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP6P35125 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP6P35125 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP6P35125 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP6P35125 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP6P35125 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP6P35125 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP6P35125 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP6P35125 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP6P35125 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP6P35125 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
USP6P35125 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP6P35125 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP6P35125 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP6P35125 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP6P35125 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP6P35125 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP6P35125 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP6P35125 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP6P35125 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP6P35125 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP6P35125 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP6P35125 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP6P35125 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP6P35125 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP6P35125 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP6P35125 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms