Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTX2P32243 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTX2P32243 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTX2P32243 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTX2P32243 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTX2P32243 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTX2P32243 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTX2P32243 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTX2P32243 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTX2P32243 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTX2P32243 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTX2P32243 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTX2P32243 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTX2P32243 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTX2P32243 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTX2P32243 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTX2P32243 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTX2P32243 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTX2P32243 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTX2P32243 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTX2P32243 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTX2P32243 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
OTX2P32243 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTX2P32243 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTX2P32243 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTX2P32243 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
OTX2P32243 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTX2P32243 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTX2P32243 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTX2P32243 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTX2P32243 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTX2P32243 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTX2P32243 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTX2P32243 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTX2P32243 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTX2P32243 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTX2P32243 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTX2P32243 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTX2P32243 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTX2P32243 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTX2P32243 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTX2P32243 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTX2P32243 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTX2P32243 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTX2P32243 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTX2P32243 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTX2P32243 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTX2P32243 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTX2P32243 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTX2P32243 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTX2P32243 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
OTX2P32243 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTX2P32243 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTX2P32243 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTX2P32243 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTX2P32243 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTX2P32243 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTX2P32243 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTX2P32243 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTX2P32243 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTX2P32243 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTX2P32243 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTX2P32243 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTX2P32243 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTX2P32243 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTX2P32243 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTX2P32243 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTX2P32243 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTX2P32243 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTX2P32243 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTX2P32243 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTX2P32243 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTX2P32243 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTX2P32243 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTX2P32243 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTX2P32243 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTX2P32243 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
OTX2P32243 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTX2P32243 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTX2P32243 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTX2P32243 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTX2P32243 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTX2P32243 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTX2P32243 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTX2P32243 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTX2P32243 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTX2P32243 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTX2P32243 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTX2P32243 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX2P32243 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX2P32243 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX2P32243 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX2P32243 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX2P32243 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX2P32243 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX2P32243 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX2P32243 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX2P32243 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX2P32243 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX2P32243 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms