Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD40LGP29965 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms