Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTX3P26022 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTX3P26022 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTX3P26022 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTX3P26022 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTX3P26022 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTX3P26022 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTX3P26022 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTX3P26022 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTX3P26022 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTX3P26022 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTX3P26022 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTX3P26022 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTX3P26022 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTX3P26022 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTX3P26022 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTX3P26022 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTX3P26022 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTX3P26022 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTX3P26022 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTX3P26022 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTX3P26022 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTX3P26022 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTX3P26022 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTX3P26022 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTX3P26022 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTX3P26022 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTX3P26022 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTX3P26022 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTX3P26022 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTX3P26022 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTX3P26022 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTX3P26022 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTX3P26022 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTX3P26022 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTX3P26022 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTX3P26022 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTX3P26022 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTX3P26022 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTX3P26022 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTX3P26022 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTX3P26022 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTX3P26022 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTX3P26022 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTX3P26022 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTX3P26022 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTX3P26022 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTX3P26022 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTX3P26022 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTX3P26022 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTX3P26022 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTX3P26022 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTX3P26022 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTX3P26022 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTX3P26022 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTX3P26022 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTX3P26022 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTX3P26022 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTX3P26022 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTX3P26022 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTX3P26022 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTX3P26022 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTX3P26022 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTX3P26022 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTX3P26022 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTX3P26022 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTX3P26022 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTX3P26022 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTX3P26022 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTX3P26022 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTX3P26022 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTX3P26022 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTX3P26022 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTX3P26022 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTX3P26022 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTX3P26022 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTX3P26022 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTX3P26022 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTX3P26022 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTX3P26022 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTX3P26022 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTX3P26022 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTX3P26022 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTX3P26022 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTX3P26022 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTX3P26022 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTX3P26022 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTX3P26022 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTX3P26022 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTX3P26022 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTX3P26022 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTX3P26022 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTX3P26022 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTX3P26022 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTX3P26022 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTX3P26022 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTX3P26022 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTX3P26022 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTX3P26022 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTX3P26022 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms